学位认证
三一神学院各种学位均由东南亚神学教育协会 (ATESEA)东南亚神学教育协会创立于1957年，三一神学院是创立协会的16所神学院之一。三一神学院讲师在协会担任领导、参加评审以及出版事宜，积极参与协会的多项事务。
东南亚神学教育协会 (ATESEA)
东南亚神学教育协会(Association for Theological Education in South East Asia, ATESEA),以前被称为东南亚神学院协会(Association of Theological Schools in South East Asia, ATSSEA), 于1957年在新加坡成立，创会会员来自本区域16间神学院，宗旨如下：
- 为会员提供有关设备，特别是一般神学院所共有的专注课题；
- 共同讨论各神学院的联系关系，及其与其他大专学府的联系；
- 提供有关神学教育标准的建议，并维持学院会员的名册；
- 在适当的处境中鼓吹神学教育的提升。
ATESEA 是建立亚洲区域各神学院彼此联系合作的先锋，合作项目包括学术研究、联合研究院课程、师资研讨会与工作坊及其他先进的活动项目。ATESEA亦制定了一套神学教育标准，以提升本区域的神学教育水平。
ATESEA的办公室目前在两个地点运作，1973年6月，办公室由新加坡迁移至马尼拉。在1981年则从马尼拉迁回新加坡而在1998年，再度迁回马尼拉。自2009年至今，该办公室被设在菲律宾怡朗市菲律宾中央大学。
2007年，ATESEA在三一神学院，它的诞生地，迎接五十周年。庆祝活动的一部分是重新审视“扼要亚洲精髓”（Critical Asian Principle，CAP ），制定于1971年，CAP是ATESEA及其研究生学位课程在神学反思上的框架。在亚洲不断变化的情况下，CAP在更新调整，现今被称为“亚洲区开拓神学之准则”
2009年，东南亚神学研究学院（South East Asia Graduate School of Theology，SEAGST），ATESA所开办的研究院，在ATESA改组时易名为ATESA神学则联盟（ATESEA Theological Union， ATU）。ATU把开办神学硕士学位的责任转托给有能力开办此课程的神学院，而ATU转为监督12所开办神学博士学位的研究中心，这12所研究中心就是有足够资源开办博士研究课程的神学院会员。